matplotlib 使おうとしたら No module named ‘_bz2’ エラーで怒られた

matplotlib 使おうとしたら No module named ‘_bz2’ エラーで怒られた.
環境構築でハマることが多いな…

概要は次の通り.

動作環境

  • CentOS 7
  • Python 3.6.5
  • matplotlib 2.2.2

背景

pipでmatplotlibのインストールは完了.
実際コードを動かそうとしたらコンソールに次のようなエラーが出た.

$ python app.py 

Traceback (most recent call last):
  File "app.py", line 3, in <module>
    from matplotlib import pyplot
  File "/home/vagrant/.anyenv/envs/pyenv/versions/3.6.5/lib/python3.6/site-packages/matplotlib/__init__.py", line 127, in <module>
    from . import cbook
  File "/home/vagrant/.anyenv/envs/pyenv/versions/3.6.5/lib/python3.6/site-packages/matplotlib/cbook/__init__.py", line 13, in <module>
    import bz2
  File "/home/vagrant/.anyenv/envs/pyenv/versions/3.6.5/lib/python3.6/bz2.py", line 23, in <module>
    from _bz2 import BZ2Compressor, BZ2Decompressor
ModuleNotFoundError: No module named '_bz2'

_bz2 ってモジュールがないよ, と怒られてる.

ちなみに app.py ファイル冒頭では次のようにいくつかのモジュールを呼び出している.

# app.py

import math
import numpy as np
from matplotlib import pyplot # <- ここでエラー

今回のエラーは matplotlib を呼び出したときに発生したもの.

解決手順

ググったらbug reportを発見.

This is a problem as _bz2 is not always installed, and not listed as a required dependency of matplotlib.
I am able to fix the issue easily by moving the import of bz2 back down
inside of the to_filehandle() function, or alternatively placing it inside a try/except block.

引用: https://github.com/matplotlib/matplotlib/issues/10866

どうやら bz2 に依存してるっぽい.
この報告者の言う方法ではなく, それに答えてくれてる方の修正commitをgithubで確認.
それ通りに修正.

念の為対象ファイルのオリジナルをコピーしておく.

# cd
$ cd /home/vagrant/.anyenv/envs/pyenv/versions/3.6.5/lib/python3.6/site-packages/matplotlib/cbook/

# backup
$ cp __init__.py __init__.py.org

# 確認
$ ls -lah | grep -i init
-rw-rw-r--  1 vagrant vagrant  86K May 25 00:21 __init__.py
-rw-rw-r--  1 vagrant vagrant  86K May 26 15:46 __init__.py.org

ok.
じゃあ変更するか.

# /matplotlib/cbook/__init__.py

# 中略

 def to_filehandle(fname, flag='rU', return_opened=False, encoding=None):
     """
     *fname* can be an `os.PathLike` or a file handle.  Support for gzipped
     files is automatic, if the filename ends in .gz.  *flag* is a
     read/write flag for :func:`file`
     """
     if hasattr(os, "PathLike") and isinstance(fname, os.PathLike):
         return to_filehandle(
             os.fspath(fname),
             flag=flag, return_opened=return_opened, encoding=encoding)
     if isinstance(fname, six.string_types):
         if fname.endswith('.gz'):
             # get rid of 'U' in flag for gzipped files.
             flag = flag.replace('U', '')
             fh = gzip.open(fname, flag)
         elif fname.endswith('.bz2'):
             import bz2 # file冒頭のimportをここで宣言するように改修

             # get rid of 'U' in flag for bz2 files
             flag = flag.replace('U', '')
             fh = bz2.BZ2File(fname, flag)
         else:
             fh = io.open(fname, flag, encoding=encoding)
         opened = True
     elif hasattr(fname, 'seek'):
         fh = fname
         opened = False
     else:
         raise ValueError('fname must be a PathLike or file handle')
     if return_opened:
         return fh, opened
     return fh


# 以下 略

↑このファイル内で to_filehandle() が呼ばれている.
その中に, ファイル冒頭でimportされている bz2 を移動.

移動先は elif fname.endswith('.bz2'): 直下.

ここまでできたら動作確認.

>>> import matplotlib
>>> 

ちゃんと読めてる.
これでmatplotlibが使えるね.

今回は以上.

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